不同16S rDNA高变区选择对细菌性阴道病菌群研究差异比较

作者：刘瑛; 张琼琼; 张蕾; 王颖; 吕涛; 陶址; 黄振宇; 廖秦平^*

来源：现代妇产科进展, 2019, 28(11): 804-807.

DOI：10.13283/j.cnki.xdfckjz.2019.11.003

• 16S rDNA高通量测序
• 引物
• 阴道菌群
• 菌群多样性

目的:分析不同16S rDNA高变区对细菌性阴道病菌群研究的差异,为选择合适的高变区扩增细菌性阴道病菌群提供理论依据。方法:选取2017年10月至2018年5月于北京清华长庚医院妇科门诊就诊的28例健康女性和10例细菌性阴道病患者,收集患者的阴道分泌物,提取细菌总DNA,分别用两对引物27F/338R和341F/806R对细菌16S rDNA的V1/V2区和V3/V4区进行PCR扩增后测序,通过分析两个高变区扩增后Alpha和Beta多样性及菌群结构的差异,比较两个高变区在细菌性阴道病菌群研究上的优势。结果:16S rDNA的V3/V4区扩增的引物较V1/V2区能扩增出更多的阴道菌种。V1/V2区扩增BV样本的加德纳菌丰度偏低。通过V3/V4区的扩增,无法将阴道健康样本中卷曲乳杆菌与母鸡乳杆菌区分开。结论:16S rDNA的V3/V4区较V1/V2区更适用于细菌性阴道病菌群结构及丰度分析。

• 单位
  清华大学