巨蛎属牡蛎DNA序列的比较及鉴定

作者：彭敏; 罗邦; 朱威霖; 杨春玲; 赵永贞; 李强勇; **云; 曾地刚; 李旻; 陈秀荔^*

来源：广东海洋大学学报, 2020, 40(01): 29-37.

DOI：10.3969/j.issn.1673-9159.2020.01.005

• 巨砺属牡蛎
• DNA条形码
• 线粒体DNA
• 核糖体RNA基因

【目的】了解巨砺属牡蛎的系统关系和种类区分。【方法】对我国沿海分布的7种巨砺属牡蛎(香港牡蛎、有明牡蛎、熊本牡蛎、岩牡蛎、艾氏牡蛎、太平洋牡蛎、葡萄牙牡蛎)的线粒体DNA片段(COI、12S、16S和t RNAs),以及核糖体RNA基因转录间隔子序列(ITS-1、ITS-2和ITS)进行分子系统学研究。【结果】无论种间或种内,t RNAs序列差异最大,亚种内TS1序列差异最大;t RNAs和COI序列较其它序列变异更快,种间变异与种内变异之间有明显的条形码间隙;12S、16S、ITS和ITS2的种间变异与种内变异无重叠及条形码间隙;ITS1的种间变异与种内变异出现重叠。在亚种层面,12S、ITS、ITS1和ITS2的亚种间变异与亚种内变异出现重叠;16S的亚种间变异与亚种内变异无重叠及条形码间隙;t RNAs与COI序列亚种间变异与亚种内变异之间有明显的条形码间隙,有利于区分亚种。【结论】t RNAs和COI序列可用于种及亚种的鉴定。

• 单位
  广西壮族自治区水产科学研究院; 广西壮族自治区水牛研究所