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摘要
分子动力学方法在化学及相关学科研究中的重要地位日趋凸显，但在本科化学实验中鲜有涉及，现有计算化学实验多侧重量子化学方法对分子性质的计算。为普及分子动力学模拟这一有力工具，同时帮助学生理解分子的动态行为，本文以丙氨酸二肽模型分子为例设计了一个简单的分子动力学模拟实验。通过本实验学生能初步掌握分子动力学模拟的基本原理、流程和分析方法，同时加深对物理化学中势能面等抽象概念的理解。本实验即可作为单独设课的计算化学实验的内容，亦可在物理化学实验中作为拓展实验开设。
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单位化学与化工学院; 山东大学
