毛果杨YABBY基因家族生物信息学分析

作者:苗嘉琪; 黄颖; 宁蕊; 刁桂萍*
来源:分子植物育种, 2023, 21(10): 3245-3252.
DOI:10.13271/j.mpb.021.003245

摘要

YABBY基因家族是仅存在于植物中的一类含有C2C2锌指结构域和YABBY结构域的转录调控因子,与植物的形态发育有关,在植物的茎、叶和花等器官的生长发育过程中起到重要的调控作用。本研究通过对毛果杨(Populus trichocarpa) YABBY基因家族生物信息学分析,共筛选出12个YABBY家族成员,分别位于第1、2、3、6、8、9、10、14、16和18号染色体。这些成员结构域保守,且具有低亲水性的特点。通过亚细胞定位预测,所有成员都定位在细胞核中。基因组织表达分析表明,毛果杨YABBY家族成员在不同组织中的表达有明显不同,在雌花、雄花和芽中表达量较高。