宫颈癌进展的生物信息学研究

作者：毛建英; 袁海涵

来源：内蒙古医科大学学报, 2020, 42(01): 20-23.

DOI：10.16343/j.cnki.issn.2095-512x.2020.01.008

• 宫颈癌
• 差异表达基因
• 生物信息学
• 癌症进展

目的:为了更好地研究宫颈癌的进展,本论文结合生物信息学分析的方法挖掘了NCBI数据库中的宫颈癌相关组织芯片,进一步分析了宫颈癌发生过程中的基因表达以及信号通路。方法:对GEO数据库进行深度挖掘,筛选数据库中的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEG),进一步挖掘宫颈癌进展过程的关键信号通路,构建宫颈癌进展过程的基因表达图谱;利用在线数据库STRING进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction network,PPI)分析及核心基因(Hub genes)的筛选,并利用GEPIA数据库分析、评估了在宫颈癌组织中核心基因的表达水平。结果:GEPIA数据库结果显示,与正常组织相比,宫颈癌组织中RFC 4、TOP2 A、PCNA、BUB 1、TPX 2及KIF 20 A的表达水平明显增加,差异有统计学意义。结论:使用生物信息学,在宫颈癌进展过程中鉴定了核心基因和富集的信号通路,可作为宫颈癌临床治疗的靶标。

• 单位
  北京市大兴区人民医院; 内蒙古自治区人民医院