2个候选lncRNA的克隆、序列分析及其在奶牛乳腺上皮细胞炎症反应中的表达

作者：董益闻; 罗仍卓么^*; 王兴平; 王晋鹏; 周力

来源：西南农业学报, 2023, 36(11): 2518-2526.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2023.11.024

• 奶牛
• lncRNA
• 乳腺炎
• 乳腺上皮细胞
• 生物信息学分析

【目的】探究2个候选lncRNA(lncRNA TCONS-72171和lncRNA TCONS-62349)在奶牛乳腺上皮细胞炎症模型中的表达与功能分析。【方法】利用基因克隆和测序技术验证候选lncRNA的真实性；并进行候选lncRNA序列同源性、亚细胞定位、靶基因预测及KEGG信号通路分析。此外，利用脂多糖(Lipopolysaccharide, LPS)诱导奶牛乳腺上皮细胞产生炎症反应；采用RT-qPCR技术检测LPS诱导0、3、6和12 h的奶牛乳腺上皮细胞内上述2个候选lncRNAs的表达情况。【结果】奶牛lncRNA TCONS-72717和lncRNA TCONS-62349真实存在，且在部分物种间高度保守；上述2个lncRNA在LPS诱导的奶牛乳腺上皮细胞中表达均呈极显著上调(P<0.01),且分别主要位于细胞质与细胞核。靶基因预测与KEGG信号通路分析预测结果显示，上述2个lncRNA的潜在靶基因(LCP2、ALOX12和ASGR1等)可能通过JAK-STAT、NF-κB和MAPK等炎症相关的信号通路而发挥调控细胞炎症的作用。【结论】表达上调的lncRNA TCONS-72171和lncRNA TCONS-62349可能在LPS诱导的奶牛乳腺上皮细胞炎症中发挥重要的调控作用，该结果可为深入研究奶牛乳腺炎分子调节机制奠定基础。

• 单位
  宁夏大学; 动物科技学院