水生态文明制度的建设与创新是水生态文明系统工程建设的关键内容。在对当前我国水生态文明制度建设的重要性与必要性分析的基础上,探讨了我国水生态文明制度建设因遵循的基本原则,并从法规体系、决策体系、管理体制、制度体系、考评体系五方面构建了水生态文明制度体系框架,为水生态文明建设系统工程提供制度保障。