红砂(Reaumuria songarica)叶绿体基因组解析及系统发育分析

作者：白慧慧; 张凯; 杜忠毓; 鲁客; 宋珊珊; 张剑锋; 段义忠

来源：分子植物育种, 2022, 1-11.

• 红砂(Reaumuria songarica)
• 叶绿体基因组
• 高通量测序
• 系统发育分析

为获得红砂(Reaumuria songarica)叶绿体基因组信息特征对其亲缘关系进行研究，可对红砂的保护遗传学及资源开发利用等研究提供分子理论基础。本研究采用Illumina HiSeq X Ten测序平台构建红砂叶绿体基因组图谱，同时利用MEGA-X软件构建红砂系统发育树。结果表明，红砂叶绿体基因组长度为157 072 bp，其中大单拷贝区(LSC)为86 543 bp、小单拷贝区(SSC)为18 441 bp、两个反向重复区(IRa和IRb)均为26 044 bp。红砂叶绿体中GC含量为36.8%，共注释到128个基因，其中蛋白编码基因83个，转运RNA (tRNA)基因37个和核糖体RNA(rRNA)基因8个，该注释基因中共包含内含子16个。此外，红砂与疏花水柏枝(Myricaria laxiflora)、匍匐水柏枝(Myricaria prostrata)、柽柳(Tamarix chinensis)及沙生柽柳(Tamarix taklamakanensis)共同构成一个单系分支。本研究不仅解析了红砂叶绿体基因组特征信息，而且对红砂的未来研究提供了一定的依据和基础。

• 单位
  中国林业科学研究院亚热带林业研究所; 生命科学学院; 榆林学院