ESCC基因表达谱分析与KRT家族基因的鉴定

作者:任婧; 王登奎; 杨瑞娜; 袁小志; 刘志伟; 王新帅*
来源:食管疾病, 2021, 3(03): 174-178.
DOI:10.15926/j.cnki.issn2096-7381.2021.03.003

摘要

目的本研究通过对食管鳞状细胞癌(ESCC)基因表达谱分析,探索ESCC发生、发展及预后的关键基因。方法从THE UCSC XENA数据库下载源自TCGA数据库ESCC和食管正常组织基因表达矩阵,通过Rstudio及在线数据库分析,鉴定关键基因。结果共获得708个显著差异表达基因,发现KRT(Keratin,角蛋白)家族在ESCC中发挥重要作用,且该家族基因中KRT5、KRT6B、KRT16、KRT79在ESCC中高表达并与ESCC患者预后差相关。结论 KRT5、KRT6B、KRT16、KRT79可能为ESCC提供潜在的治疗靶点。

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