基于生物信息学分析卵巢癌免疫细胞浸润程度及其与预后的关系

作者：熊璐; 苑雪萍; 徐冲; 许琳; 韩旭东^*

来源：国际检验医学杂志, 2021, 42(17): 2141-2145.

• 卵巢癌
• 免疫细胞
• 预后分析
• ssGSEA
• Cibersort

目的探讨免疫细胞浸润程度与卵巢癌生存预后的关系。方法通过生物信息学方法,从GEO数据库下载卵巢癌患者的组织芯片测序数据和临床分期、病理分级、生存状态、生存时间等信息。通过ssGSEA基因集的各项免疫评分,将卵巢癌患者分为高分组和低分组。通过生存曲线比较滤泡辅助性T细胞(Tfh)高、低评分组的生存预后情况。通过Cibersort软件计算肿瘤组织中各类免疫细胞浸润的比例,并进行相关性分析。结果 Tfh评分与预后生存有关(P<0.05)。Tfh高分组的浆细胞、活化的NK细胞、M1型巨噬细胞浸润程度明显高于低分组(P<0.05),而M2型巨噬细胞的浸润程度则明显低于低分组(P<0.05)。结论卵巢癌中存在不同程度的免疫细胞浸润,Tfh浸润可能是影响卵巢癌患者预后的因素。

• 单位
  北京市中关村医院