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摘要
本研究从5种冰草叶绿体基因组中各筛选出52条蛋白编码序列，利用CodonW、SPSS、EXCEL等软件对其进行密码子偏好性使用模式分析。结果显示，在RSCU分析结果中，共有31个高频密码子，有28个是以A/U结尾，密码子偏好性在冰草叶绿体基因组中的表现较弱。中性分析结果显示，自然选择在冰草叶绿体基因组密码子偏好性发挥作用；在有效密码子数的结果中，偏好性多受突变影响；PR2-plot分析结果，大部分基因由选择调控。此外筛选出8个高频高表达的最优密码子，分别为CGA、UUG、UCA、GAU、UUU、UCC、GGA、ACA。冰草叶绿体基因组密码子偏好性种间差异不显著，且根据中性分析、ENC-plot、PR2-plot分析密码子偏好性可能受多种因素共同作用。最优密码子的选择，为冰草叶绿体基因组工程中外源性基因表达效率的提高奠定基础。
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