摘要

目的 分析拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)基因的表达与CD4+ T细胞在肝细胞癌(HCC)中的数量相关性及临床预后意义。方法 利用基因注释资源数据库(BioGPS)、基因表达谱交互作用分析(GEPIA)和Kaplan-Meier Plotter数据库分析TOP2A mRNA在正常肝组织和HCC组织中的表达以及对HCC患者生存预后意义;利用GENE和Metascape数据库分析TOP2A的共表达基因及其基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Sangerbox数据库分析TOP2A基因与微卫星不稳定(MSI)和DNA错配修复基因的相关性;再分别利用TISIDB和TIMER数据库分析TOP2A基因与CD4+ T细胞和各种免疫细胞的关系,并分析CD4+ T细胞对HCC患者生存预后的影响。结果 TOP2A mRNA在正常肝组织和CD4+ T细胞中表达不显著,而在HCC组织中显著高表达,不利于患者的生存预后;TOP2A共表达基因的GO功能主要富集在细胞有丝分裂和细胞增殖上,而KEGG主要富集在细胞循环和铂类化疗药物耐药通路;TOP2A基因的表达与MSI、 DNA错配修复基因MutS同源物2(MSH2)与MSH6、肿瘤细胞纯度以及各种免疫细胞的数量显著正相关;各种免疫细胞在HCC中均发生一定的拷贝数变异,但仅有CD4+ T细胞的数量对HCC患者生存预后有显著影响。结论 HCC组织中TOP2A mRNA表达与CD4+ T细胞数量呈正相关,不利于HCC患者的生存预后。

全文