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摘要
目的通过生物信息学方法了解小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构特征,为小麦变态反应性疾病的诊断和预防提供依据。方法在Uniprot数据库中获得Tri aBd 27k蛋白序列,通过DNAStar预测B细胞抗原表位,NetMHCⅡ和Syfpeithi预测T细胞抗原表位;使用Swiss-Model软件预测其三维结构并用Ramachandran进行稳定性评估。在Uniport数据库搜索Tri a Bd 27k的同源蛋白,应用Clustalx1.83及Mega3.1构建同源进化树。结果小麦过敏原Tri a Bd 27k的B/T细胞共同抗原表位优势区域为34-42、102-117,Ramachandran软件预测结果显示小麦Tri a Bd 27k蛋白的空间构象稳定。结论通过对小麦过敏原Tri a Bd 27k进行生物信息学分析获得了该过敏原优势区域及三维结构模型,为进一步了解和掌握小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构功能打下理论基础。
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单位呼吸疾病国家重点实验室; 广州医学院第二附属医院
