基于转录组测序的姬松茸镉胁迫下内参基因筛选

作者：黄在兴; 陈华; 翁伯琦; 刘斌; 王义祥^*; 刘朋虎^*

来源：微生物学报, 2021, 61(11): 3458-3470.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.20210046

• 巴西蘑菇
• 镉胁迫
• 不同组织
• 荧光定量PCR

【目的】筛选不同实验条件下,尤其是镉胁迫下的姬松茸内参基因,为研究姬松茸镉富集相关基因功能研究奠定基础。【方法】根据不同浓度Cd (0、2、5 mg/L)胁迫下菌丝中转录组表达量数据,筛选出18个候选基因,设计了30对引物;根据引物扩增的特异性、扩增效率初步筛选出来自不同基因的5对引物;运用qRT-PCR检测了5个基因在不同浓度Cd胁迫下的菌丝样品、原基、菌柄和菌盖中的Ct值,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper对这些基因的表达稳定性进行评价。【结果】SGT2和STK是菌丝阶段Cd胁迫下最稳定的2个候选内参基因,GAPDH是不同组织中最稳定的内参基因,SGT2、STK和GAPDH是所有实验条件下最稳定的3个内参基因。【结论】在姬松茸镉胁迫条件下,本研究筛选出的SGT2和STK比常用的内参基因表现出更强的稳定性。

• 单位
  福建农林大学; 福建省农业科学院; 国家菌草工程技术研究中心; 广西大学