基于CTD数据库的双酚A及其衍生物双酚F和双酚S的生物信息学分析

作者：刘福志; 朱丹丹; 陈扬佳; 邓锂峰; 肖默; 涂卓特^*

来源：毒理学杂志, 2022, 36(05): 442-455.

DOI：10.16421/j.cnki.1002-3127.2022.05.011

• 双酚A
• 双酚F
• 双酚S
• 比较毒理基因组学数据库
• 生物信息学分析

目的 利用生物信息学技术分析双酚A(bisphenol A, BPA)及其衍生物双酚F(bisphenol F, BPF)、双酚S(bisphenol S, BPS)共同影响的关键信号通路及可能的机制，为BPA及其衍生物BPF、BPS相关研究提供一定的线索和思路。方法 利用比较毒理基因组学数据库(CTD),筛选BPA及其衍生物BPF、BPS共同影响的hub基因，使用可视化和Hipolt在线工具对hub基因进行通路分析，筛选关键基因。结果 获得BPA及其衍生物BPF、BPS共同影响的50个hub基因，其中EGFR基因Degree最高为22。GO和KEGG富集分析，得到具有统计学意义的差异GO条目140个(P<0.05),分别为生物学途径(biological processes, BP)有119个，细胞组分(cellular components, CC)有5个，分子功能(molecular function, MF)有16个，其中BP间有较多交互基因，如EGFR、ESR1和CAV1等。KEGG分析中具有统计学意义差异最高的2条通路，包括膀胱癌(P=3.40×10-6)和甲状腺癌(P=5.21×10-5),并且膀胱癌信号通路主要受到EGFR和CDK4等基因的调控。结论 本次基于2021年4月更新的CTD数据库所开展的生物信息学分析提示，BPA及其衍生物BPF、BPS共同暴露可能引起关键基因EGFR改变，EGFR可能通过成纤维细胞增殖影响膀胱癌的发生发展。

• 单位
  泉州医学高等专科学校