环境DNA检测鱼类的方法及应用

作者:沈梅; 肖能文; 卢林; 罗遵兰; 史娜娜; 孙光
来源:水生态学杂志, 2021, 1-16.
DOI:10.15928/j.1674-3075.202103040058

摘要

随着人类活动的影响,鱼类资源正在急剧下降,开展鱼类监测对鱼类多样性保护具有非常重要的意义。传统的鱼类监测方法具有生态破坏性、且对调查者专业形态学知识要求高、调查工作量大等弊端,故亟需新的技术方法进行辅助补充。环境DNA(eDNA)技术是从环境样本中捕获DNA,并对其进行提取、扩增、测序和分类,进而确定取样环境中生物分布状况的方法。该技术使得鱼类调查更加省时省力、节约成本、无损伤,目前在鱼类监测中被广泛使用。然而eDNA技术也存在着一定的缺陷,不能完全取代传统方法。eDNA技术包含了样品的采集及处理、eDNA提取、eDNA扩增、测序和生物信息学分析几个主要步骤,每个步骤又可采取不同的实验方案,来影响eDNA的检测效率。eDNA技术主要应用于鱼类物种多样性监测、入侵物种检测、濒危物种检测和鱼类生物量的估算等方面。虽然国内eDNA的起步不晚,但相比国外研究方向较为单一,研究深度不高,需要进一步重视。

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