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摘要
5-甲基胞嘧啶（5-methylcytosine, m5C）是一种重要的转录后修饰，大量证据表明，m5C在许多生物学过程中起着至关重要的作用.准确鉴定m5C位点有助于更好地了解其生物学功能.为此提出了一个名为pm5C-BGRU的模型，该模型通过拼接独热编码（One-hot encoding）和核苷酸化学性质（nucleotide chemical property, NCP）进而对RNA序列进行特征提取，并基于双向门控循环单元（Bidirectional Gated Recurrent Unit, BiGRU）来识别m5C位点.将该方法在人类、小鼠和拟南芥三个物种的m5C数据集上进行建模和测试，并对照已有的预测模型进行评估.结果表明，pm5C-BGRU在交叉验证和独立数据集测试中均取得优异效果，该模型有望成为鉴定m5C位点的有力工具.
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