烟草丙酮酸脱羧酶家族生物信学分析

作者：王天龙; 梁永标; 何俊龙; 李江美; 李春荣; 高文佑; 官崇植; 苏家恩^*

来源：湖南农业科学, 2020, (03): 4-7.

DOI：10.16498/j.cnki.hnnykx.2020.003.002

• 烟草
• 丙酮酸脱羧酶
• 蛋白特性
• 聚类分析
• 生物信息学

为研究烟草丙酮酸脱羧酶家族特性,运用ProtScale、CDD、Interpro、Muscle、phyml和TreeDyn等工具分析烟草丙酮酸脱羧酶家族各成员的亲疏水性、结构域和进化树。结果表明:NtPDC1和NtPDC2具有亲水性,属于可溶性蛋白,NtPDC3,NtPDC 4,NtPDC5和NtPDC6具有疏水性,为非可溶性蛋白;烟草丙酮酸脱羧酶属于硫胺素焦磷酸(TPP)依赖性酶超家族,各成员均含有3组结构域,分别为N-末端TPP结构域、中心域和C-末端TPP结构域;烟草、拟南芥、水稻、薏苡和玉米的丙酮酸脱羧酶聚类为4组,其中烟草丙酮酸脱羧酶主要聚集在Ⅰ组和Ⅱ组,其进化相对保守。

• 单位
  云南省烟草公司大理州公司