摘要

为研究mRNA三级结构对蛋白质折叠速率的影响,首先计算所选蛋白质相应mRNA的三级结构,在此基础上计算局部碱基对参量,分析这些参量对蛋白质折叠速率的影响;然后将所选蛋白质按照不同的蛋白质折叠类型和二级结构进行分组,进而分析局部碱基对参量与不同类蛋白质折叠速率的相关性。结果表明,局部碱基对参量中两碱基原点y轴方向相对位移(Stretch)、两碱基原点z轴方向相对位移(Stagger)、两碱基平面绕x轴旋转夹角(Buckle)和绕y轴旋转夹角(Propeller)均与蛋白质折叠速率存在相关性,说明mRNA三级结构的局部碱基对参量是影响蛋白质折叠速率的有效因素。