基于RNA-Seq的5'-核苷酸酶基因挖掘及真核表达分析

作者：林善^*; 邹志成; 张汉成; 周翠冰

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(09): 4116-4121.

DOI：10.13417/j.gab.039.004116

• 5’-核苷酸酶
• 克隆
• 表达
• 序列分析

为进一步阐明5’-核苷酸酶(5’-NT)在菌类中药虫草素生物合成中的作用机理,本研究依据已经建立好的中华被毛孢RNA-Seq数据信息,设计目的基因引物,从中成功克隆到1个5’-NT基因,并在毕赤酵母中实现了异源表达。测序结果证实该基因全长1 968 bp,共编码656个氨基酸残基。BLAST分析表明其与NCBI中5’-核苷酸酶的最高同源性达98%;ProtProm分析表明相对分子质量为72.989 kD,等电点为5.83;利用Predict Protein预测了二级结构,α螺旋结构占21.04%,延伸链结构占21.49%,无规则卷曲结构占57.47%。本研究为人工调控虫草素的生物合成提供更充分的科学依据和新思路。

• 单位
  中山大学中山医学院; 深圳市第二人民医院