HCV RNA阳性标本PCR-荧光探针法病毒亚型未检出原因分析

作者：张立丽; 侯玉丽; 赵艳明; 黄雁翔; 于艳华; 娄金丽; 赵艳

来源：临床检验杂志, 2017, 35(04): 268-270.

DOI：10.13602/j.cnki.jcls.2017.04.08

• 丙型肝炎病毒
• 病毒基因型
• 病毒变异
• 病毒载量

目的探讨血清HCV RNA阳性,但PCR-荧光探针法病毒亚型检测未检出的原因。方法收集2015年7月至2016年3月北京佑安医院临检中心分子室病毒载量>1 000 IU/m L但未测出病毒亚型的标本55例,采用基因测序方法对病毒扩增产物进行分型分析。结果 55例HCV病毒载量>1 000 IU/m L,但HCV病毒亚型未检出的标本中,其中3例为病毒载量接近病毒亚型检测下限,经测序分析为1b型2例,2a型1例;5例为检测试剂盒未覆盖亚型并且其探针位置无突变,HCV 1a型4例,6n型1例,占9.1%(5/55);47例因探针序列位置基因突变导致病毒亚型未检出,占85.5%(47/55),经测序发现其中1a型6例(6/47,12.8%),1b型32例(32/47,68.1%),2a型3例(3/47,6.4%),2b型1例(1/47,2.1%),3b型1例(1/47,2.1%),6a型2例(2/47,4.3%),1b、6q、6c混合型1例(1/47,2.1%),6n型1例(1/47,2.1%)。探针序列位置基因突变组中以HCV病毒5’非翻译区(5’UTR)204 C/T突变为主(31/47,66.0%),其次为5’UTR 168 C/A突变(5/47,10.6%)。结论病毒载量低、试剂盒覆盖的病毒亚型有限、探针对应的序列存在变异均会影响PCR-荧光探针法检测HCV基因型,其中探针序列变异是病毒亚型未测出的主要原因。

• 单位
  首都医科大学附属北京佑安医院