毛白杨PtoMnSOD基因克隆及生物信息学分析

作者：韩佩尧; 田彦挺; 赵烨; 纪清巨; 李娟; 郭琪; 侯荣轩; 孙宇涵; 李云^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(01): 105-112.

DOI：10.13271/j.mpb.020.000105

• 毛白杨
• MnSOD基因
• 生物信息学分析

为了揭示毛白杨锰超氧化物歧化酶基因PtoMnSOD在植物抗逆中的功能。本研究通过RT-PCR方法获取毛白杨PtoMnSOD基因序列,并对该基因及其编码蛋白进行生物信息学分析。结果显示:PtoMnSOD基因开放阅读框(ORF)为699 bp,编码232个氨基酸,具有PF00081和PF02777两个保守结构域,属于MnSOD亚家族。其编码的蛋白含有20个磷酸化位点,是无跨膜结构、无信号肽且定位于线粒体的不稳定亲水性蛋白。同源序列比对显示,不同物种的MnSOD氨基酸序列具有很强的保守性。研究结果为进一步开展毛白杨锰超氧化物歧化酶基因PtoMnSOD的功能研究奠定了理论基础。

• 单位
  北京林业大学