基于网络药理学探讨桃红四物汤促进骨折愈合的主要活性成分及作用机制

作者:乔宇; 袁发浒; 卯玉嵘; 王昕; 胡骏; 赵志刚*
来源:江汉大学学报(自然科学版), 2022, 50(04): 53-62.
DOI:10.16389/j.cnki.cn42-1737/n.2022.04.007

摘要

目的 运用网络药理学探索“桃红四物汤”的主要活性成分,以及促进骨折愈合的作用机制。方法 利用中药系统药理数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索“桃红四物汤”(THSWT)中所有药物对应的活性成分,并筛选出其活性成分所对应的作用靶点。运用GeneCards数据库平台挖掘与骨折愈合(fracture healing,FH)相关作用靶点,构建“药物-疾病”共同靶点Venn图。利用Cytoscape 3.8.2软件,绘制“药物活性成分-靶点-疾病”的网络调控图,借助String 11.5构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,获得PPI网络核心基因的邻接节点数目,再运用Cytoscape 3.8.2对PPI网络进行拓扑分析,最终获取核心基因。通过R语言包clusterProfiler进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测“桃红四物汤”对促进骨折愈合的作用机制。结果 研究预测得到“桃红四物汤”有效成分69个,涉及5 345个作用靶点。确定骨折愈合靶点2 383个,得到共同靶点基因140个,运用PPI分析确定ALB、AKT1、VEGFA、MMP2、MMP9、CASP3、JUN、MYC等是促进骨折愈合的核心靶点。富集分析GO条目2 258项(P <0.05),KEGG信号通路151条(P <0.05),主要富集通路有PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路等。结论 “桃红四物汤”可通过多靶点、多通路促进骨折愈合,为深入揭示其作用机制提供了研究方向,后续可继续通过体内外实验进一步验证靶点的有效性。

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