百合LdGASA1基因克隆与生物信息学及表达分析

作者：李雪艳; 胡新颖; 白一光; 王伟东; 周俐宏; 赵统利; 杨迎东^*; 刘威生^*

来源：分子植物育种, 2023, 21(14): 4579-4586.

DOI：10.13271/j.mpb.021.004579

• 百合
• 鳞茎发育
• GASA基因
• 生物信息学分析
• 表达分析

本研究从百合小鳞茎发育不同阶段蛋白质组数据中，筛选出调控鳞茎发育的上调表达基因LdGASA1，对其进行克隆、生物信息学分析及表达分析。序列分析显示LdGASA1基因全长725 bp，编码区CDS序列为336 bp，编码111个氨基酸。结构域分析显示，LdGASA1第52至第111个氨基酸含有一个典型的GASA保守结构域。其理化性质分析显示，编码蛋白质理论等电点(pI)为9.1，不稳定系数为35.14，属于稳定的疏水性蛋白，亚细胞定位预测该蛋白最可能定位在细胞质中，其二级结构主要为无规则卷曲(65.86%)和α-螺旋(22.52%)，另外含有少量延伸链(12.60)和β-折叠(9.01%)。通过RT-qPCR分析发现LdGASA1基因在小鳞茎出现前表达量相对较低，主要在小鳞茎形态建成和发育阶段表达，且在小鳞茎形态基本建成(35 d)时表达量达到最高。本研究结果为探索GASA基因调控百合生长发育的机制打下基础。

• 单位
  连云港市农业科学院; 辽宁省农业科学院