稻属AA染色体组8个种间SSR多样性与亲缘关系

作者：杨致荣; 李润植; 魏兴华

来源：中国水稻科学, 2006, (06): 589-595.

DOI：10.16819/j.1001-7216.2006.06.005

• 稻属
• AA染色体组
• 简单重复序列标记
• 多样性
• 亲缘关系 Oryza
• AA genome
• simple sequence repeat marker
• diversity
• genetic relationship

选用平均分布于水稻基因组的30对SSR引物,对AA染色体组8个野生稻种共42份材料的遗传多样性及遗传关系进行了研究。结果显示,本试验选取的30个SSR标记均具有多态性,多态性位点百分率为100%。30个多态性位点共扩增出的等位基因数为224,每个位点可扩增出3~10个等位基因,平均7.47个;等位基因有效数(Ae)变幅为1.25~8.91,平均5.45。多样性指数中,Shannon多样性指数(I)为0.454~2.386,平均1.826;而Nei基因多样性指数变幅为0.199~0.888,平均0.774。系统聚类和带型分析结果表明,亚洲栽培稻(Oryza sativa)与普通野生稻(O.ruf...

• 单位
  中国水稻研究所; 山西农业大学; 水稻生物学国家重点实验室