云岭牛HMGA2基因InDel多态及其与生长性状的关联分析

作者:李世鹏; 汪富文; 史颖超; 项门们; 雷初朝; 党瑞华*
来源:河北大学学报(自然科学版), 2020, 40(04): 421-426.

摘要

为了探索高迁移率蛋白2(high mobility group AT-hook 2,HMGA2)基因插入缺失(InDel)多态与云岭牛体尺性状的关联性,以356头云岭牛为实验对象,采用多聚酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增、聚丙烯酰胺凝胶电泳和Sanger测序的方法检测HMGA2基因的遗传变异,并利用SPSS软件对其InDel多态性与云岭牛体尺性状进行了关联分析.结果发现,在HMGA2基因的ARS-UCD1.2 5:47872723位点存在15bp缺失,并根据缺失的类型,分为野生型(Ⅱ)、杂合型(ID)、突变型(DD)(I:insertion,D:deletion),这3种不同的基因型所对应的个体,在腹围性状方面存在显著差异,而在其他的体尺性状上则不存在显著差异.因此,可以把HMGA2基因此位点InDel多态作为云岭牛腹围性状选择的候选分子标记,应用于肉牛新品种的标记辅助培育.