王庆其教授临床善用内经理论诊治消化系统疾病及各种杂病,在多年的临床实践中运用"阳化气"理论治疗功能性消化不良(FD)。对以胃痞为主要症状的FD患者,王庆其教授常用行气通阳或益气通阳之法;对以胃痛为主要症状的FD患者,王庆其教授常用疏肝理气,和胃降逆之法。