广灵驴PDGFD基因克隆、生物信息学分析及其时序表达研究

作者：李丽; 邱丽霞; 李武峰^*; 王曦

来源：东北农业大学学报, 2023, 54(06): 53-63.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2023.06.007

• 广灵驴
• PDGFD基因
• 基因克隆
• 组织表达

血小板源性生长因子D(Platelet derived growth factor D, PDGFD)基因与调控脂质沉积紧密相关。为探究广灵驴不同组织中该基因表达水平，使用RT-PCR技术，以18月龄广灵驴背最长肌cDNA为模板，克隆该基因CDS区，分析生物信息学。围绕广灵驴和晋南驴心、肝、脾、肺、肾、皮下脂肪和背最长肌，利用qPCR技术分别比较该基因在广灵驴同月龄不同组织和同一组织不同月龄表达水平以及两个品种在36月龄各组织中的表达水平。结果表明，PDGFD基因CDS长1 095 bp(GenBank登录号：OP482072)，编码364个氨基酸，同源性比对广灵驴与马亲缘关系最近，与红原鸡最远。qPCR检测该基因在广灵驴背最长肌和皮下脂肪中mRNA表达量随月龄呈极显著增加（P<0.001）。该基因在36月龄广灵驴心脏、肝脏和皮下脂肪mRNA表达量均高于同月龄晋南驴。推测该基因与心脏、肝脏、皮下脂肪和背最长肌发育调控紧密相关。研究为深入探究该基因在广灵驴脂质代谢调控机制奠定理论基础。

• 单位
  山西农业大学; 生命科学学院