菠萝蜜BRI1家族成员生物信息学的预测与对比

作者：杨欣蓉; 于旭东; 吴繁花^*; 蔡泽坪; 罗佳佳; 曹佩娜

来源：分子植物育种, 2021, 19(01): 100-110.

DOI：10.13271/j.mpb.019.000100

• 菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)
• BRI1
• 蛋白家族

菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)是热带地区常见的木本植物之一,具有较高的经济和科研价值。本研究采用已完成菠萝蜜幼苗茎叶的全长转录组测序(PRJNA579273),在此基础上对菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus) BR INSENSITIVE 1 (BRI1)家族成员Ah BRI1、Ah BRL1和Ah BRL2进行生物学信息分析,将基因翻译成蛋白。以菠萝蜜为主,将其与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、川桑(Morus notabilis)和毛果杨(Populus trichocarpa)利用在线分析工具分析得到不同的理化性质数据以及蛋白的二、三级结构。得到不同物种BRI1蛋白家族之间生物信息学的预测与对比。结果表明,其氨基酸残基数分别为1 195、1 170和985,理论等电点为6.32、5.77和7.08,蛋白呈弱酸性,具有一定亲水性,较为稳定;存在分泌途径信号肽或叶绿体转运肽,具有跨膜结构;二级结构主要元件为无规则卷曲和琢-螺旋,三级结构为螺旋管状结构。本研究为进一步对菠萝蜜BRI1蛋白家族成员的功能研究提供依据。

• 单位
  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所; 海南大学; 农业部