石蒜属叶绿体trnL-F序列的变异与系统聚类分析

作者：袁菊红; 孙视; 彭峰; 冯煦; 郑玉红; 夏冰

来源：中国中药杂志, 2008, (13): 1523-1527.

• 石蒜属
• tmL-F序列
• 序列变异
• 分子鉴别
• 系统树 Lycoris
• trnL-F sequences
• nucleotide variation
• molecular identification
• phylogenetic tree

目的:分析比较石蒜属和近缘属植物中国水仙trnL基因的部分序列和trnL-trnF间隔区的完整序列,为石蒜属物种鉴别和种间亲缘关系分析提供分子佐证。方法:采用PCR产物直接双向测序法,用Clustal X 1.81,MEGA 2.0软件进行序列分析,采用最大简约法(maximum parsimony,MP)构建系统发育树。结果:所测物种的序列全长在905～1036 bp,经排序后,两端切平,得到886 bp的整齐序列,所测物种的核苷酸变异位点14个,信息位点10个,主要在trnL内含子区,这些位点可用于区分石蒜属物种;4个碱基"ATAT"缺失/插入是区别石蒜属与其近缘植物水仙的显著特征。重建的...

• 单位
  中国科学院