一种基于13个基因的结直肠癌预后风险预测模型的开发和验证

作者：荀德旭; 冯舒琪; 赵园春; 闫东辉; 张元辰; 陈佳佳; 吴杰^*; 齐鑫^*

来源：基因组学与应用生物学, 2023, 42(08): 878-887.

DOI：10.13417/j.gab.042.000878

• 结直肠癌
• 预后模型
• 生存预测
• 免疫状态
• 化疗反应

结直肠癌（colorectal cancer,CRC）是全球范围内最常见的消化道恶性肿瘤之一，鉴于基因的异常表达在CRC发病机制中的关键作用，本研究旨在开发一种多基因预后风险预测模型以对CRC患者的生存结果进行分层和预测。在3个独立的转录组数据集中鉴定人类CRC肿瘤组织样本和正常结直肠组织样本之间的显著差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）；基于219个重叠的DEGs，通过单因素Cox回归分析鉴定出31个具有预后价值的基因；采用LASSO Cox回归分析构建一个由13个基因组成的预后模型，其预后预测效果通过KM(Kaplan-Meier)生存分析和时间依赖性ROC分析在验证集中得到验证。多因素Cox回归分析表明，基于该模型的风险评分可以作为CRC患者生存结局[包括总生存期（overall survival,OS）、无病生存期（disease free survival,DFS）和疾病特异性生存期（disease special survival,DSS）]的独立预测因子。功能分析表明，该模型与CRC患者的免疫状态和化疗反应密切相关。此外，联合基于该模型的风险评分和常见临床病理因素构建的列线图对CRC患者的预后也具有较强的预测能力。本研究构建的基于13个基因的预后模型有望为CRC患者风险分层、生存预测和治疗评估提供有力的工具。

• 单位
  苏州科技大学; 生命科学学院; 苏州大学附属第一医院