摘要
目的 预测华支睾吸虫全长cDNA质粒文库中cs002d09号EST序列的结构和功能特征及编码蛋白的应用前景. 方法 利用NCBI和ExPaSy等生物信息学网站在线分析工具和Vector NTI suite及PcGene等软件包,分析华支睾吸虫全长cDNA质粒文库中cs002d09号EST序列及其编码蛋白的理化性质、结构与功能特征. 结果 BLASTx分析该EST序列是组织蛋白酶Cathepsin L1的同源基因,全序列长为1 458 bp,包含完整的编码区80~1 191,编码371个氨基酸,前18个氨基酸是分泌信号肽, 蛋白的理化性质较稳定.该蛋白有2个空间构象相对独立功能域:N端的抑制功能域和C端的活性功能域,抑制功能域含有3个线性B细胞抗原表位,同源性较低;C端活性功能域同源性较高, Cys177, His318和Asn338组成催化中心,位于底物结合裂缝的底部. 结论 华支睾吸虫Cathepsin L1基因与多个物种的Cathepsin L1基因同源,编码蛋白可能是重要的虫体分泌排泄抗原成分,在华支睾吸虫病的免疫诊断和疫苗研究方面有较好的应用前景.
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单位中山大学; 基础医学院