摘要
为了解纤花香茶菜的基因组信息,本研究利用Illumina高通量测序技术对纤花香茶菜3个不同生育期的叶片进行转录组测序,同时对4个组织部位的混合样品进行转录组测序,以丰富纤花香茶菜基因组信息。共获得92.3 Gb Clean Data,每份样品的Clean Data均在6.81 Gb以上,Q30碱基百分比在93.38%以上。组装获得71 238条Unigene,功能注释结果显示,有55.12%的Unigene比对到6大数据库。共预测到1 127个转录因子,归属于33个不同的TF家族。共检测到SSR位点21 432个,SSR出现频率为30.09%,各种重复基元类型均存在,其中二核苷酸重复分布最多。本次测序结果为纤花香茶菜功能基因的挖掘、次生代谢途径解析和遗传多样性分析提供了丰富的基因组信息。
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