LncRNA AL110200对脂多糖刺激的应答及其靶基因预测与鉴定

作者：索苗苗; 蔺亚晖; 吕文斐; 宋燕; 张禅那; 张银辉; 惠汝太; 陈敬洲

来源：中国分子心脏病学杂志, 2013, 13(05): 682-685.

DOI：10.16563/j.cnki.1671-6272.2013.05.011

• 长链非编码RNA
• lncRNA AL110200
• PPARβ/δ
• 炎症反应

目的炎症反应被认为是动脉粥样硬化的始动环节,也是防止动脉粥样硬化的重要靶点。众多基因参与调控此过程,PPARβ/δ可通过参与炎症反应从而影响动脉粥样硬化。我们通过生物信息学分析发现lncRNA AL110200可能影响PPARβ/δ的表达,从而我们推测lncRNA AL110200可能通过调节PPARβ/δ表达从而影响动脉粥样硬化炎症反应。本研究旨在通过体外实验研究lncRNA AL110200对炎症刺激物脂多糖的应答并初步验证其靶基因。方法我们首先使用qRT-PCR检测在炎症刺激物脂多糖(LPS)刺激下lncRNA AL110200表达量的改变;然后我们再利用qRT-PCR检测了lncRNA AL110200干扰和过表达后PPARβ/δmRNA表达水平的改变。结果我们研究发现LPS可上调lncRNA AL110200(1.85倍,P<0.001)和PPARβ/δ(2.67倍,P<0.01)表达;但是无论高表达还是低表达lncRNA AL110200都不影响PPARβ/δ的表达。结论综上所述,我们的研究发现,动脉粥样硬化炎症刺激物LPS可以上调lncRNA AL110200及PPARβ/δ表达,但是PPARβ/δ非lncRNA AL110200的靶基因。

• 单位
  心血管疾病国家重点实验室; 北京协和医学院; 国家心血管病中心; 中国医学科学院