宁波市肠道病毒71型分离株全基因序列对比分析

作者：顾文珍; 董红军; 倪红霞; 张姝; 易波; 杨天池; 谢蕾; 许国章

来源：中国公共卫生, 2012, (09): 1236-1239.

• 肠道病毒71(EV71)型
• 全基因序列
• 同源性 EV71
• genome
• homology

目的探讨浙江宁波地区2010年分离的肠道病毒71型(EV71)中神经毒性相关位点。方法采集宁波地区2010年手足口病不同症状患者粪便标本,进行荧光聚合酶链反应检测,阳性标本病毒分离;分8个片段对EV71全基因序列和VP1区进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、克隆、测序、拼接、同源性比较,用DNAstar推导其内含子编码的氨基酸序列并比对分析。结果 6株分离株基因全长均为7 406 bp,核苷酸同源性为97.9%～99.4%,其中3株死亡病例标本内部核糖体进入位点(IRES)中的124、272及408位,碱基分别为T、G、A,区别于其他3株手足口轻症患者分离株的A、A和G;3株死亡病例标本位...

• 单位
  宁波市疾病预防控制中心