塔里木河荒漠化防治功能区生态环境脆弱,经济发展落后,其生态的脆弱与经济发展的贫困,导致生态保护与经济发展很难兼顾,生态补偿机制的建立与健全对解决二者矛盾有重要意义。本文对生态补偿等相关概念进行梳理,结合塔里木河荒漠化防治功能区的实际情况,运用模糊分析法对其进行综合评价。研究发现:塔里木河荒漠化防治功能区生态补偿机制运行的状况并不是很好,只过了及格线,其生态补偿机制的建设仍需进一步完善。