微生物小开放阅读框:小蛋白及翻译调控研究进展

作者：杨婕; 张安琪; 冯家勋; 赵帅^*; 赵心清^*

来源：微生物学报, 2023, 63(01): 1-14.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.20220257

• 小开放阅读框(sORF)
• 小蛋白
• 上游开放阅读框(uORF)
• 翻译调控
• 微生物基因组

小开放阅读框(small open reading frame, sORF)广泛存在于不同生物基因组中,由于其序列短,以及编码的产物小蛋白(smallprotein,或称微蛋白;microprotein或迷你蛋白miniprotein)检测困难等原因,小开放阅读框长期未得到充分注释和研究。近年来,随着高通量测序、翻译组和质谱分析等技术的不断发展,在不同生物中发现大量新的小开放阅读框,其编码的小蛋白及介导的翻译调控已应用于药物开发及植物抗病机理等研究。但是,目前对微生物的小开放阅读框相关研究和应用还相对有限。本文综述了小开放阅读框编码产物小蛋白的发现和鉴定,以及上游开放阅读框(upstream open reading frame, uORF)对mRNA翻译调控等最新研究进展,重点介绍了微生物基因组中小开放阅读框的鉴定和功能研究进展,为深入认识微生物中小开放阅读框的功能和作用机制,以及植物和动物等高等其他生物的小蛋白和翻译调控相关研究提供参考。

• 单位
  上海交通大学; 生命科学技术学院; 微生物代谢国家重点实验室; 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室