科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
作为RNA诱导沉默复合体（RISC）的核心元件，AGO蛋白能特异性地招募miRNA或siRNA从而参与mRNA的沉默，AGO蛋白不仅参与调控植物生长发育，还参与调控植物逆境胁迫的应答。本研究利用生物信息学方法对蓖麻全基因组进行筛选、比对，结合Smart和Pfam在线软件，获得8个编码RcAGOs蛋白的基因家族，并对其基因家族成员的序列信息、理化性质、系统进化树、二级结构、三维结构模型以及互作蛋白进行预测和分析，结果表明蓖麻AGO蛋白长度917～1 063 aa，分子量为102 703.39～117 809.90 Da，等电点在8.90～9.51之间，亲水性为-0.524～-0.355，不稳定系数大于40，为不稳定蛋白。蓖麻AGO蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。系统进化分析显示蓖麻AGO蛋白分布在三个分支上，这与拟南芥系统进化关系一致，表明它们具有较高的同源性。AGO蛋白中的PIWI结构域高度保守，8个RcAGOs蛋白都含有DEDD/H基序。利用String软件对蓖麻AGO互作蛋白预测，结果发现，8个RcAGOs蛋白均与Ribonuclease III （核糖核酸酶Ⅲ）和ATP binding protein （ATP结合蛋白）互作。本研究为RcAGO基因家族的鉴定与功能研究提供参考。
- 单位
