本发明公开了一种水性双组分环氧防腐涂料及其制备方法。本发明的水性双组分环氧防腐涂料由A组分和B组分组成,A组分由锌粉、成膜助剂、分散剂、增稠剂、防沉剂和固化剂组成,B组分由环氧树脂、氧化石墨烯浆料、防闪锈剂和水组成,A组分和B组分的质量比为0.8:1~1.5:1。本发明的水性双组分环氧防腐涂料具有锌粉含量低、可挥发性有机物含量低、制备工艺简单等特点,形成的涂层防腐性能优异、致密度高、附着力大、抗冲击性能优异,适合进行大规模生产应用。