塔里木兔线粒体基因组全序列分析与系统进化研究

作者：黄娅琳; 黄捷; 时玉; 徐燕红; 周用武; 侯森林

来源：野生动物学报, 2021, 42(01): 71-80.

DOI：10.19711/j.cnki.issn2310-1490.2021.01.009

• 塔里木兔
• 线粒体基因组
• 特征分析
• 遗传多样性

塔里木兔是我国新疆地区特有物种,已被列为国家Ⅱ级重点保护动物。本研究基于所测定的塔里木兔线粒体全基因组序列(全长17 011 bp),进行了全序列的结构分析,结果表明塔里木兔线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个控制区。除了nad6在L链上以外,其他的蛋白质编码基因都在H链上。基于线粒体基因序列,通过生物信息学预测发现除了trnM和trnS 1以外,其余tRNA都有经典的三叶草二级结构。线粒体全基因组具有AT偏好性,其结构与目前兔属其他物种线粒体基因组结构类似。并基于塔里木兔和GeneB ank已有的12种兔属物种线粒体全基因组序列,分别用ML法和NJ法构建系统进化树,对其系统发生进行了探讨,结果表明塔里木兔与蒙古兔的亲缘关系较近。

• 单位
  南京森林警察学院; 广西科技大学