饲喂复合乳酸菌制剂对犊牛粪便微生物多样性及其功能的影响

作者：包海林; 董晨扬; 魏曼琳^*; 李明辉; 孙芳^*; 巨纪; 杜柳; 张润泽; 晓明

来源：中国微生态学杂志, 2023, 35(01): 16-23.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.202301003

• 高通量测序
• 复合乳酸菌制剂
• 犊牛
• 粪便
• 微生物多样性

目的 本试验利用高通量测序技术探究复合乳酸菌制剂对犊牛粪便微生物多样性、组成结构的影响并进行功能预测。方法 选取3头体重为（150±10） kg的安格斯犊牛散栏饲养，犊牛自由采食基础日粮。试验开始后，在基础日粮上灌喂15 mL复合乳酸菌制剂，每日两次，连续7 d。分别于试验期第0 d、第3 d和第7 d肛门采集基础牛粪便（第0 d:D0；第3 d:D3；第7 d:D7），采用16S rRNA测序对微生物进行多样性分析和功能预测。结果 从犊牛粪便样品中共获得优化序列258 156条，OTU聚类共获得1 409个OTU。通过α-多样性分析发现，与D0组相比，D3组犊牛粪便微生物Ace指数（F=6.541,P=0.031）和Chao1指数（F=10.898, P=0.010）显著升高，Shannon指数（F=0.277,P=0.767）和Simpson指数（F=0.097,P=0.909）无显著性变化。PCA分析发现，未饲喂复合乳酸菌制剂与饲喂乳酸菌制剂的犊牛粪便微生物组成存在显著差异（R=0.366,P=0.049）。在门水平上，粪便中的厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌门。与D0组相比，D7组髌骨细菌门的相对丰度显著增加（F=6.750,P=0.029），螺旋体门的相对丰度极显著增加（F=4.838,P=0.001）。在属水平上，与D0组相比，D3组和D7组的罗姆布茨菌属（F=7.798,P=0.021）和克里斯藤森菌属R-7(F=9.405,P=0.014)的相对丰度显著升高，unclassified＿f＿Lachnospiraceae的相对丰度（F=7.006, P=0.027）显著下降。通过COG和KEGG功能注释分析，发现饲喂组氨基酸代谢（F=5.438,P=0.045）、核苷酸代谢（F=0.236,P=0.030）和其他氨基酸代谢（F=11.088,P=0.017）的丰度显著升高。结论 饲喂复合乳酸菌制剂对犊牛的肠道微生态环境具有一定的积极作用。

• 单位
  内蒙古民族大学; 黑龙江省农业科学院; 动物科技学院