孙一奎是明代新安地区医家,为新安固本培元派创始人汪机之再传弟子,精通儒道之说,崇宋元理学之义,将固本培元进一步发展,以顾护下焦肾命为主创命门动气说。笔者以宋元之理学、道教内丹学说为切入点,言及其对其命门动气说的影响,同时对其命门动气说与呼吸、三焦之气的关系进行了进一步的阐述,并以《孙文垣医案》之泄泻病案为例,阐释了命门动气说对治疗泄泻的指导意义,抛砖引玉,为诸同道今后对命门动气的探索提供参考。