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摘要
目的 利用DNA条形码ITS2、rbcL-a、psbA-trnH序列,对甘肃道地药材岷县当归(岷归)及其近缘属药材东当归进行鉴定分析。方法 对供试材料ITS2、rbcL-a、psbA-trnH序列进行PCR并双向测序后,用DNAMAN v.4软件将得到的正向序列和反向序列进行组合,得到连续序列。利用BLAST算法对序列进行了分析。用Expasy在线软件翻译psbA和rbcL-a的序列编码,用MEGA 6软件进一步分析核苷酸序列。用MUSCLE算法对序列进行比对,最后在NCBI数据库中提供的序列对本研究中产生的psbA-trnH条码位点序列进行了系统分析。结果 ITS2、rbcL-a、psbA-trnH的序列长度分别为505、677、324 bp。在rbcL-a条码位点中,对齐序列的标识率最高,为96.3%,其次是ITS2(81.78%)和psbA-trnH(67.9%)识别能力与其他两个条码位点相比建立了psbA-trnH条码位点最大的条码位点。采用邻接(Neighbour- Joining,NJ)方法,观察到岷归序列在同一簇中排列,东当归序列在不同簇中排列。DNA条码psbA-trnH可明显检测到岷归当中东当归的混杂。结论 利用ITS2、psbA-trnH DNA条形码位点标记可以检测到岷归中的东当归混杂及程度。
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