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摘要
开发青藏扁蓿豆（Medicago archiducis-nicolai）单核苷酸多态性标记（single nucleotide polymorphism，SNP），并开展遗传多样性初步分析，为青藏扁蓿豆种质资源的评价与利用提供理论支持。以5个青藏扁蓿豆群体共80份材料进行GBS（genotyping-by-sequencing）测序，采用GATK软件开发SNP标记，并以此进行遗传结构和遗传多样性的初步分析。测序产生的序列数据量为60.79 Gb，过滤后共获得12 796个SNP位点，且SNP突变类型存在明显的转换型偏差现象。不同地理来源青藏扁蓿豆群体观测杂合度（HO）为0.187 68-0.304 36，期望杂合度（HE）为0.201 97-0.364 34，遗传多样性指数（Pi）为0.178 32-0.241 34；祁连（QLCD）群体具有相对最高的遗传多样性水平。遗传结构分析表明5个群体分为2组，且群体遗传距离与地理距离之间存在极显著的正相关性。SNP标记适用于青藏扁蓿豆遗传多样性分析。
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