奥利万星中间体A82846B产生菌拟孢囊菌CCTCC M2020063全基因组序列分析与mbtH类基因的验证

作者：程雯; 蒲桂洪; 牛国清; 邹祥^*

来源：微生物学报, 2021, 61(12): 3977-3990.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.20210112

• 荒漠拟孢囊菌
• 奥利万星
• A82846B
• 全基因组组装
• mbtH类基因
• 卤化酶基因

【目的】分析荒漠拟孢囊菌CCTCCM2020063中A82846B合成的代谢途径和关键基因。【方法】使用Illumina二代测序和PacBio三代测序技术对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行全基因组测序,利用Glimmer预测编码序列,使用HPLC和LCMS鉴定次级代谢产物,使用antiSMASH5.0软件预测次级代谢产物合成基因簇。利用Geneious软件对A82846B合成相关基因进行分析,对其中的mbtH类基因着重分析。【结果】本实验菌株鉴定为荒漠拟孢囊菌(Kibdelosporangiumaridum),基因组中有一条线性染色体,无质粒,序列全长12475688bp,GC含量为66.27%,有11900个开放阅读框,共有47个基因簇。该菌株具有合成A82846B的能力,且生物合成相关基因位于Cluster32,包含33个基因,mbtH类基因gene07864的过表达促进A82846的合成,提升了26.42%,卤化酶基因为gene07859,与万古霉素、巴利霉素的卤化酶相似度较高。【结论】本研究对荒漠拟孢囊菌CCTCC M2020063进行了基因组序列分析,获得了A82846B生物合成相关的功能基因信息,为A82846B的代谢途径和工程改造提供了强有力的基础。

• 单位
  西南大学