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摘要
为了明确油棕LOX基因种类、特性及其在油棕生长发育中的调控作用，本研究以拟南芥LOX蛋白序列为标签，在油棕全基因组数据库中BLAST同源LOX蛋白序列，并通过CDD和PFAM数据库对LOX蛋白序列进行分析，利用生物信息学对油棕LOX家族成员进行染色体定位、进化树、基因结构及保守结构域等可视化分析。结果表明，共获得75个油棕LOX基因，其中有61个基因在油棕的15条染色体上分布不均匀，在12号染色体上分布的基因最多，为10个；基因长度范围为1 550 bp ～99 179 bp，外显子数目为1～24个；油棕LOX基因家族共含有10个motif保守基序；通过预测蛋白的二级结构，发现EgLOX蛋白均存在α-螺旋、β-转角、无规卷曲及延伸链这4种结构，其中57个蛋白以无规卷曲为主要结构，18个蛋白以α-螺旋为主要结构，而β-转角及延伸链所占比例均较少；通过表达模式分析发现EgLOX基因在油棕中果皮、果仁、根、叶、茎和花中均有不同程度的表达，具有组织和时空表达特异性。基因重复和组织表达特异性是油棕EgLOX基因家族的两大特点，推测该家族基因在油棕脂质降解过程中起调控作用。本研究为油棕LOX的功能研究提供一定的参考。
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单位中国热带农业科学院椰子研究所; 海南省热带油料作物生物学重点实验室
