异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位

作者：梁瑾; 王靖飞; 吴春艳; 冯宝龙

来源：中国预防兽医学报, 2010, (01): 1-4.

• 构象表位预测
• 异源抗体
• 分子对接 discontinuous epitopes prediction
• heterogenous antibody
• molecular docking

为了对异源抗体对接方法预测流感病毒血凝素B细胞构象表位的可行性进行分析,本研究基于蛋白质相互作用界面的形状互补理论,使用异源抗体(来自于抗原抗体复合物1G9M、1RVF、1TPX、1NCA、1A2Y)的晶体结构同流感病毒血凝素(A/Aichi/2/68(H3N2))的晶体结构进行刚性分子对接,通过计算B细胞表位的预测表面和实际表面C-α原子之间的RSMD以及表位氨基酸的准确率,分析用异源抗体探测出血凝素B细胞表位的可能性。结果表明,不同的异源抗体均可结合到A/Aichi/2/68(H3N2)的已知B细胞表位,最佳的对接构象与原晶体结构重叠后表位残基C-α原子的均方根偏差均小于0.6埃,表位氨基...

• 单位
  东北农业大学; 兽医生物技术国家重点实验室; 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所