"两委"干部交叉任职方式运行中存在的问题主要有制度执行漏洞、政府缺乏支持力度、干部信心不足和群众意识有差距等。出现这些问题的原因主要是农村传统思想观念影响深、村民意识受影响、两委干部联系服务群众少等。文章提出,要从分类指导、合理推进,培育意识、推动民主,加强"堡垒型+服务型"党组织,提高能力,提振信心,增强政府公信力着手,提高交叉任职率。