基于WGCNA联合网络药理学探究防己地黄汤治疗类风湿关节炎的作用机制

作者：王金; 孟祥文; 陈丝梦; 程芷洛; 庆兆^*; 贾晓益^*

来源：现代药物与临床, 2023, 38(04): 776-787.

• 防己地黄汤
• 类风湿关节炎
• 加权基因共表达网络分析
• 网络药理学
• 汉黄芩素
• 槲皮素
• 肿瘤蛋白53
• 胱氨酸蛋白酶3

目的 利用网络药理学和加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法探讨防己地黄汤治疗类风湿关节炎的分子机制。方法 利用TCMSP、SwissTargetPrediction、HERB数据平台及相关文献检索防己地黄汤的主要活性成分及其相关靶点，通过R软件limma包对GEO平台类风湿关节炎数据集GSE110169进行差异分析。基于WGCNA筛选与疾病相关的基因模块。利用R软件VennDiagram包进行交集靶点分析。通过Cytoscape的cytoHubba插件筛选核心靶点基因。采用Cytoscape软件进行“药物–活性成分–靶点–疾病”网络构建与分析。clusterProfiler包对交集靶点基因进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。通过PyMOL软件对核心活性成分与核心靶点基因进行分子对接验证；并运用CIBERSOTR进行核心靶点基因的免疫浸润分析。结果 共筛选出有效活性成分129个，相关靶点1 280个，基因芯片差异基因2 091个；筛选出3个与疾病相关的基因模块；获得药物与疾病共同靶点139个；KEGG通路分析显示，主要富集在T细胞受体信号通路、NOD样受体信号通路、Toll样受体信号通路等；筛选出汉黄芩素和槲皮素2个核心成分及肿瘤蛋白53(TP53)和胱氨酸蛋白酶3(CASP3)2个核心靶点基因。分子对接显示，核心成分与核心靶点之间均具有稳定的结合能力；免疫浸润分析表明，核心靶点基因与多数免疫细胞关系密切。结论 防己地黄汤可能从抗炎、调节免疫细胞功能等多方面发挥对类风湿关节炎的治疗作用。

• 单位
  安徽中医药大学