亚麻荠油体蛋白基因家族的生物信息学分析

作者：郭绩宁; 马彦波; 郭之乐; 杨镒婴; 薛佳蕊; 陈辉龙; 王巍杰

来源：分子植物育种, 2022, 1-22.

• 亚麻荠
• 油体蛋白
• 基因家族
• 生物信息学

本研究在亚麻荠(Camelina Sativa)全基因组中，运用生物信息学方法鉴定了48个油体蛋白(oleosin)家族基因，并在理化性质、系统发育关系、保守基序、高级结构、跨膜结构域、基因在染色体上的分布以及表达这些方面进行分析。48个亚麻荠油体蛋白(Csoleosin)序列长度为79～494 aa，分子量为8.045 66～54.526 78 kDa，理论等电点pI介于5.38～10.98之间；亚麻荠Oleosin基因家族系统发育树分析显示亚麻荠Oleosin可分成3个亚族；48个亚麻荠Oleosin基因都具有Oleosin结构域的特定保守基序；Csoleosin蛋白都是以α-螺旋和无规则卷曲这两种方式为主；48个Csoleosin蛋白全部具有膜结合结构域；染色体定位发现Csoleosin家族的基因复制方式是串联重复；表达分析发现Csoleosin基因在种子发育时期发挥重要作用。以上研究结果对亚麻荠Oleosin基因家族的后续研究具有一定的意义。

• 单位
  生命科学学院; 华北理工大学